Synchytrium endobioticum: aspectos diagnósticos para encuestas

Synchytrium endobioticum Causa la enfermedad de la verruga de la papa. Synchytrium endobioticum es un parásito obligado que no produce hifas sino esporangios, que contienen zoosporas móviles. Los esporangios de verano tienen paredes delgadas y una vida corta. Se forman en el tejido de la patata y dan lugar a nuevas infecciones por zoosporas. Las esporas en reposo (a veces también denominadas esporangios de invierno, esporas de invierno, soros en reposo o soros de invierno) tienen paredes gruesas y permanecen viables durante períodos de tiempo extremadamente largos, incluso en ausencia de un huésped. Estos se pueden producir durante toda la temporada de crecimiento. Se liberan de las verrugas en descomposición al suelo. El diagnóstico de S. endobioticum afecta tanto a la planta, en la que se pueden haber formado verrugas, como al suelo, que puede
transportar esporas en reposo.

Se han descrito numerosos patotipos (razas) en S. endobiótico Estos se definen por su virulencia en cultivares de papa diferenciales. El patotipo 1(D1) rara vez se reporta infectando la papa en Europa porque pocos cultivares de papa son susceptibles a él, aparentemente debido a la disponibilidad de resistencia dominante en el huésped. Otros patotipos se reportan ahora con mayor frecuencia en Europa Occidental, y se encuentran particularmente en las zonas montañosas lluviosas de Europa Central y Oriental. También se presentan fuera de Europa (por ejemplo, en Terranova, Canadá y en la parte asiática de Turquía). La resistencia a estos patotipos es rara, por lo que el control es más difícil. Los patotipos distintos del 1(D1) se distinguen por su virulencia diferencial en cultivares de papa específicos, pero por lo demás parecen estar más estrechamente relacionados entre sí que con el patotipo 1(D1). Medidas internas recomendadas en EPPO Los países exigen que se identifiquen los patotipos.

La identidad de los esporangios de verano o de las esporas en reposo observadas al microscopio puede confirmarse mediante PCR convencional,
y PCR en tiempo real. La PCR convencional se basa en el espaciador transcrito interno de la región del ADN ribosomal (ITS) con el cebador directo hibridado con ITS1 y el cebador inverso hibridado con ITS2. La PCR en tiempo real de van Gent-Pelzer et al. (2010) se basa en ITS2. La PCR en tiempo real de Smith et al. (2014) que se describe aquí se basa en ribosomas de subunidades pequeñas (SSU).
ADN (ADNr 18S). La PCR en tiempo real desarrollada por Bonants et al. (2015) se basa en un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) asociado al patotipo 1 (D1) identificado mediante el análisis de reducción de la complejidad de secuencias polimórficas (CRoPS). Cuando se utiliza material de verruga de patata, se utiliza un control de aislamiento positivo interno dirigido al gen COX de la planta para controlar la eficacia del aislamiento del ADN. El patotipo 1 (D1) se puede distinguir de al menos los patotipos 2 (G1), 6 (O1) y 18 (T1) mediante PCR en tiempo real.

Referencia: MP 7/28 (2) Synchytrium endobioticum. EPPO Boletín, 47: 420–440. https://doi.org/10.1111/epp.12441